Procesos Metalúrgicos y Sistemas Particulados: Dedicada al estudio de los procesos minero-metalúrgicos, incluyendo procesamiento de minerales, electro-hidro y pirometalurgia, junto a sus operaciones unitarias asociadas y los fenómenos de interacción fluido-partícula.  

Modelación Simulación y Optimización de Procesos: Se encarga del estudio de los sistemas de ingeniería de procesos centrado en la toma de decisiones basado en modelos. Su aplicación cubre procesos de generación de energía, minero-metalúrgicos, ambientales y biotecnológicos.

Termofluidodinámica: Modelación y simulación de sistemas fluidos con acoplamientos térmicos usando técnicas computacionales tipo CFD. Aplicaciones en ventilación de túneles, fluidos térmicos, procesos de solidificación interacción fluido-estructuras. 

Biotecnología, Bioprocesos y Procesos de Separación: Estudia los mecanismos y procesos usados para la conversión, separación y transformación de bioprocesos. Los énfasis son en separación de proteínas, biotecnología de alimentos, tratamiento de residuos líquidos, bioenergía y procesos de separación no convencionales.

Combustión, Conversión de  Energía y Contaminación Atmosférica: Dedicada al desarrollo y estudio de procesos  para la producción, el almacenamiento, transporte y uso eficiente de la energía con agentes convencionales y no convencionales (renovables) junto con su impacto en la contaminación atmosférica desde la generación de contaminantes aéreos, transporte, dispersión y mitigación, aplicando técnicas de experimentación y de simulación computacional.